Wykopywanie chrzanu spomiędzy innych roślin zwykle na niewiele się zdaje. Wystarczy zostawić w ziemi mały fragment korzeni, by wyrósł nowy chwast. Co więcej, pocięcie korzeni w trakcie ich usuwania sprawia, że roślin jest coraz więcej. Dlatego, żeby się pozbyć chrzanu, należy bardzo dokładnie wydobyć z ziemi wszystkie jego części. Wiąże się to, niestety, z koniecznością przekopania rabaty.
Zamiast tego można zastosować herbicyd o nazwie Roundup. Nanosi się go na liście chrzanu pędzelkiem, uważając, żeby nie kapnął na inne rośliny. Po kilku lub kilkunastu dniach, zależnie od pogody, roślina zaschnie. Gdyby zdarzyło się, że chrzan odbije, nowe liście też należy pomalować Roundupem. W ten sam sposób można się pozbyć innych uciążliwych chwastów.